A Jordânia situa-se na Ásia Ocidental, entre as latitudes 29 e 33 graus norte e as longitudes 34 e 39 graus este, na margem oriental do rio Jordão. O país cobre cerca de 89.342 quilómetros quadrados e divide-se em quatro grandes regiões naturais: as terras altas orientais da Margem Leste, o vale do Rift com o rio Jordão, o Mar Morto e o golfo de Aqaba, o planalto desértico oriental da Badia e as terras baixas de Wadi Araba a sul.
As terras altas ocidentais correm de norte a sul e ultrapassam os 1.500 metros em alguns pontos; o ponto mais alto é o Jabal Umm ad-Dami, com 1.854 metros no sul, enquanto o ponto mais baixo da Terra, a superfície do Mar Morto, se situa cerca de 430 metros abaixo do nível do mar ao longo da fronteira ocidental. A maior parte da população vive nas terras altas, especialmente em redor de Amã, Zarqa e Irbid.
A este e a sul, o deserto da Badia cobre cerca de 80 por cento do país, parte do deserto arábico. O único acesso da Jordânia ao mar é uma curta costa de cerca de 26 quilómetros no golfo de Aqaba, um braço do Mar Vermelho, partilhada com Israel e o Egito do outro lado da água. Esta geografia compacta permite ao viajante passar das terras altas mediterrânicas às dunas do deserto e às águas quentes do Mar Vermelho num único dia.